Наряду с Новосибирским академическим симфоническим оркестром в филармонии работают 19 коллективов, предлагающих взрослым и детям классические, джазовые, эстрадные, фольклорные, музыкально-литературные и образовательные концертные программы. В их числе: Филармонический камерный оркестр, «Filarmonica»-квартет, Ансамбль солистов «Новосибирская камерата», Русский академический оркестр, Новосибирская хоровая капелла, Биг-бэнд Владимира Толкачёва, Джаз-оркестр «Сибирский диксиленд», Ансамбль «Маркелловы голоса», Вокальный ансамбль Павла Шаромова, Ансамбль ранней музыки «Insula magica», Эстрадный оркестр, Концертный духовой оркестр, Фольклорный ансамбль «Рождество», Ансамбль медных духовых «Сибирский брасс», Фортепианный дуэт Геннадий Пыстин – Дмитрий Карпов, Дуэт «Resonance», Театральный коллектив «Ангажемент».
Помимо организации концертов своих коллективов филармония занимается гастрольными проектами, а также проводит ряд крупных международных фестивалей: Международный Рождественский фестиваль искусств, Транссибирский Арт-Фестиваль, Sib Jazz Fest, Белый фестиваль и другие.
С начала 2000-х годов выступления филармонических коллективов проходят на сцене Камерного зала филармонии (историческое здание Дом Ленина). В сентябре 2013 года открылся Государственный концертный зал имени Арнольда Каца.